【追記リスト】
まだ全然調べられてないんですが、備忘のために生徒さんからの質問を書いておきます。
①廃藩置県前に、年貢を中央政府に上げていなかった藩はどこ？
②奥羽列藩同盟など、最後まで新政府軍に歯向かった藩の知藩事は？
③版籍奉還のときに領域に変化があった藩は？
歴史部員みんなで地元の初代知藩事を調べたのですが、なんか役に立ちそうな辞典を見つけたので、紹介しておきます。
高価なので、図書館にGOですね。
②の回答１：奥羽列藩同盟リスト（2023/08/09追記）
生徒の質問「奥羽列藩同盟など、最後まで新政府軍に歯向かった藩の知藩事は？」
諸説あるのですが、奥羽越列藩同盟が結ばれた1868年5月の同盟加盟藩は以下のとおりです。
松前藩・弘前藩・八戸藩・久保田藩・亀山藩・本荘藩・矢島藩・新庄藩・天童藩・山形藩・上ノ山藩・米沢藩・村上藩・黒川藩・新発田藩・三根山藩・村松藩・長岡藩・盛岡藩・一関藩・仙台藩・中村藩・下手渡藩・磐城平藩・湯長谷藩・泉藩・福島藩・二本松藩・三春藩・守山藩・棚倉藩・会津藩
この中で、会津戦争が佳境に入った９月に入った時点でまだ反抗していたのは、
盛岡藩・一関藩・天童藩・山形藩・仙台藩・上ノ山藩・米沢藩・福島藩・下手渡藩・会津藩といったところです。これに長岡藩を加えたあたりが、最後まで新政府軍に歯向かった藩と考えていいでしょう（後日、微修正の可能性あり）。
③の回答１（2023/08/09追記）
生徒の質問「版籍奉還のときに領域に変化があった藩は？」
参考文献が一般書（『江戸300藩の意外な「その後」』）なんで、もう少し調べたいのですが、基本的には版籍奉還にいたる前、戊辰戦争が終わったときに、減封や転封をくらっていたみたいです。
例
盛岡藩：20万石から13万石に減封。
会津藩：28万石から３万石に減封・転封。
仙台藩：62万石から28万石に減封。
長岡藩：７万４千石から２万４千石に減封。
といったところです。
版籍奉還のときに変化があったのかどうかは、別に調べなければなりませんね。。。がんばります。。。
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